대한민국의학한림원

제35회 의학용어 원탁토론회

2014. 05. 21(수) 오후 3시

대한의사협회 5층 회의실

목 차

◈제35회 의학용어 원탁토론회 일정...........................................................................................1

[주제발표]

◈주제발표 1. MeSH에 대하여: 정소나(가톨릭대학교 성의교정 도서관 사서)...............2

◈주제발표 2. UMLS 소개: 김석일(가톨릭의대 의료정보학과 교수/대한민국의학한림원 의학용어개발및표준화위원)............................................16

[지정토론]

◈지정토론 1. 이춘실(숙명여대 문헌정보학과 교수)............................................22

◈지정토론 1. 부유경(을지대학교 의료경영학과 교수)

	제35회 의학용어 원탁토론회
	주제 : Medical subject Headings(MeSH)와 Unified Medical Language System(UMLS) 2014. 05. 21(수) 오후 3시 대한의사협회 5층 회의실
	사회 : 조승열 (대한민국의학한림원 의학용어개발및표준화위원장) 3:00 - 3:10 개회인사 3:10 - 3:40 주제발표 정소나(가톨릭대학교 성의교정 도서관 사서). 3:40 - 4:10 김석일 (가톨릭의대 의료정보학 교수 / 대한민국의학한림원 의학용어개발및표준화위원) 4:10 – 4:30 휴식 4:30 - 4:45 지정토론 이춘실 (숙명여대 문헌정보학과 교수) 4:45 - 5:00 부유경 (을지대학교 의료경영학과 교수) 5:00 - 6:00 자유토론 6:00 폐회

주제발표1: MeSH에 대하여

정소나

(가톨릭대학교 성의교정 도서관 사서)

1. 들어가는 말

Medical Subject Headings (MeSH)는 미국 국립의학도서관(US National Library of Medicine, NLM)에서 구축한 의학분야의 대표적인 주제명 통제어휘집으로 의학용어를 유의어(Entry Terms), 상위어(Broader Term), 하위어(Narrower Term) 그리고 관련어(Related Term) 등으로 정의해 놓은 시소러스(Thesaurus)이다.

MeSH는 1960년 “Index Medicus(New Series)” 발간과 함께 4,400개의 용어를 수록한 “Medical Subject Headings: Main headings, Subheadings, and Cross references used in the Index Medicus and the National Library of Medicine Catalog”란 서명으로 초판이 발행되었다[1]. 서명에서 알 수 있듯이 MeSH는 NLM에서 구축하는 의학문헌에 대한 색인과 목록을 위해 만들어진 통제어 리스트였다.  이제 MeSH는 컴퓨터 시스템의 발전과 함께 데이터베이스 색인과 검색에 사용되고 있고 MeSH 표목이 27,000여개로 늘어났으며, 어휘의 상호참조(Cross-references), 기입어(Entry terms)를 포함하면 123,000여개에 이른다. 현재 NLM에서는 MeSH를 MEDLINE, AIDSLINE, TOXLINE, CANCERLIT 등의 데이터베이스와 LocatorPlus와 같은 NLM 소장목록의 주제색인에 사용하고 있다[2].

뿐만 아니라 MeSH는 근거중심의학의 대표적인 데이터베이스인 Cochrane Library, 심리학 및 정신의학 분야의 데이터베이스인 PsycInfo,  Centre for Reviews and Dissemination(CRD) DB 등 세계 많은 기관에서 구축하는 의학관련 데이터베이스, 의료 정보, 단행본 그리고 논문의 분류 및 색인을 위해 사용되고 있다. 따라서 생의학분야에서 가장 성공적이고 널리 활용되는 시소러스라 할 수 있다. 우리나라에서도 대한의학학술지편집인협의회에서 구축하고 있는 KoreaMed의 경우 22만건 전체 레코드에 MeSH가 부여되어 있다.

국제의학학술지 편집인위원회(International Committee of Medical Journal Editors, ICMJE)의 ‘2006년도 생의학학술지 투고 원고의 통일양식’에는 저자키워드를 Index Medicus에 기술된 MeSH 용어로 사용하라고 권장하고 있다[3]. 또한 많은 의학학술지가 투고규정에 MeSH로 저자키워드를 작성할 것을 권고하기도 한다. NLM에서는 매년 11월에 새로운 연구의 경향을 반영하여 MeSH에 새로운 용어를 추가하고, 기존 용어의 삭제 및 변경을 하는 등 MeSH 용어의 관리를 체계적으로 하고 있다.  따라서 MeSH를 활용하는 것은 국제적인 통일성과 용어의 일관성을 유지시켜 준다는 점에서 중요하다.

이 글의 목적은 MeSH의 특징과 유형을 알아보고 의학용어집에 MeSH를 활용한 사례를 살펴보는데 있다. 이는 향후 의학용어집의 작성시에 MeSH를 활용하는 것이 필요한지, MeSH를 어떻게 활용할 것인지, 활용시에 고려해야할 사항이 무엇인지를 검토할 때 참고가 될 것이다.

2. MeSH의 특징과 유형

MeSH는 매년 11월에 새로운 연구의 경향을 반영하여 새로운 용어의 추가, 기존용어의 삭제 및 변경된다. MeSH는 2007년까지 인쇄본으로 출판되었으나 이제는 웹페이지인 MeSH Browser (http://www.nlm.nih.gov/mesh/MBrowser.html)로만 제공된다[4]. MeSH 파일은 http://www.nlm.nih.gov/mesh/filelist.html 에서 무료로 내려받을 수 있다[5].

2014 MeSH에는 27,149개의 디스크립터가 있다. 2013 MeSH에는 23,182개였는데 304개의 용어가 추가되었고 8개의 용어가 삭제되었으며 40개의 용어가 변경되었다[6]. 특정용어가 언제부터 MeSH 용어로 채택되었는지는 MeSH Browser의 이력주기(history note)에서 연도별로 확인이 가능하다. 이는 PubMed/ MEDLINE 검색에 있어 중요한 정보가 된다. 온라인 주기(online note)에는 MEDLINE 검색가능 년도를 기술하고 있다.

2.1 MeSH 특징

MeSH는 통제(controlled)된 언어이다. 즉, 하나의 개념에 하나의 용어를 부여한다는 의미이다. 예를 들어 Cancer, Tumors, Neoplasia, Neoplasms는 같거나 비슷한 의미를 가지고 있지만 실제 논문에서는 저자가 각기 다른 단어를 사용한다. 이 경우 같은 의미를 가진 단어에 대하여 Neoplasms이라는 용어로 통일하여 색인하기로 약속되어 있다면 검색시에 Cancer, Tumors, Neoplasia, Neoplasms중에 하나의 검색어만 입력해도 Cancer, Tumors, Neoplasia, Neoplasms이 포함된 모든 논문을 찾게 된다. 이 경우 통제된 단어인 Neoplasms는 MeSH 디스크립터(Descriptor)에 해당하고,  Cancer, Tumors, Neoplasia는 기입어에 해당한다.

MeSH는 개념간의 상, 하위 관계를 갖는 계층구조(Tree Structures)로 이루어졌다. MeSH는 최상위 16개 범주 (Category)로 부터 가장 세부적인 개념까지 최대 11단계까지 계층을 이룬다 (그림 1).

Anatomy + [A] (해부)

Organisms + [B] (생물체)

Diseases + [C] (질병)

Chemicals and Drugs + [D] (화학물질과 약물)

Analytical, Diagnostic and Therapeutic Techniques and Equipment + [E]

(분석, 진단, 치료적 기술과 기구)

Psychiatry and Psychology + [F] (정신의학과 심리학)

Phenomena and Processes + [G] (현상과 과정)

Disciplines and Occupations + [H] (학문분야와 직업)

Anthropology, Education, Sociology and Social Phenomena + [I]

(인류학, 교육, 사회학과 사회현상)

Technology and Industry, Agriculture + [J] (기술, 산업, 농업)

Humanities + [K] (인문과학)

Information Science + [L] (정보학)

Named Groups + [M] (인구 집단)

Health Care + [N] (보건 의료)

Publication Characteristics + [V] (문헌유형)

Geographicals  + [Z] (지명)

그림 1. MeSH 계층구조의 16개 범주

각 범주는 2자리 숫자의 계층번호(Tree Number)와 결합하여 하위범주(Subcategories)로 세분화된다. 하위범주 하에 MeSH는 일반적인 수준에서 특정적인 수준까지 3자리 번호를 추가하면서 최대 11단계까지 확장된다.

참고로 이러한 계층구조는 검색할 때 두 가지 이점(利點)이 있다. 첫째, 검색 시에 용어를 상위개념으로 넓게(more general) 검색하거나 하위개념으로 좁혀(more specific) 검색할 수 있고 둘째, 특정 개념의 현재 계층 하에 있는 모든 MeSH 용어를 같이 검색할 수 있는 확장(explosion) 검색이 가능하다.

MeSH는 하나이상의 계층 관계를 가지기도 한다. 그림 3의 MeSH Browser 화면에서 사각형 박스의 “Diabetes Mellitus, Type 2”는 하위범주 C18의 Nutritional and Metabolic Diseases”와 하위범주 C19의 “Endocrine System Diseases”의 하위어임을 알 수 있다. 예를 들면 PubMed/MEDLINE에서 “Diabetes Mellitus[MeSH]”를 검색하는 경우 빨간색 사각형 박스의 “Diabetes Mellitus [MeSH]” 하위어를 모두 검색할 수 있고, 계층구조를 참고하여 상위어나 하위어로 검색어를 선택할 수 있다[7].

그림 2.  MeSH 계층번호

그림 3. “Diabetes Mellitus, Type 2” 계층구조

2.2 MeSH 유형

MeSH 유형에는 디스크립터(Descriptors), 한정어(Qualifiers), 그리고 보조개념레코드(Supplementary Concept Records, SCRs)가 있다[5].

2.2.1 디스크립터 (Descriptors)

디스크립터는 의학 문헌에 나타난 개념들을 표현하는 용어로 MeSH 용어(MeSH terms), MeSH 표목(MeSH Heading)으로 불리운다(이하 MeSH 표목으로 기술함). 문헌의 주제와 관련된 주표목(Main Heading)이 디스크립터의 대부분이지만 문헌유형(Publication Types), 지역, 국가 등의 지리적 구분을 나타내는 지리 표목(Geographicals), 체크태그(Check Tags)와 같이 비주제 디스크립터(Non Topical Descriptor)도 있다. 디스크립터 종류(Descriptors Class)를 다음의 4가지로 나누어보면 종류 1은 주제 디스크립터(Topical Descriptor)라 할 수 있고, 종류 2에서 종류 4는 비주제 디스크립터로 특히 검색에서 제한 기능으로 활용한다[7].

종류 1 = 주제 디스크립터

종류 2 = 문헌유형

종류 3 = 체크태그(계층번호 없음)

종류 4 = 지리표목(범주 [Z])

MeSH 표목은 색인어로 MEDLINE에 입력되는 MeSH 용어이고, 기입어(Entry Terms)는 MeSH 표목으로 채택되지 않은 용어로 MeSH 표목의 다양한 형태 즉, 축약어, 단수와 복수형, 유사어 또는 동의어들이다. 기입어는 상호참조되어 디스크립터로 대체되어 검색된다. 예를 들면 ‘Vitamin C’의 MeSH 표목, 즉 MeSH 용어는 “Ascorbic Acid”이다. ‘Vitamin C’ 이외에도 ‘Magnorbin’, ‘Magnesium Ascorbicum’, ‘Hybrin’, ‘Ascorbic Acid, Monosodium Salt’, ‘Ferrous Ascorbate’,  ‘L-Ascorbic Acid’, ‘Sodium Ascorbate’ 등이 MeSH 표목인 “Ascorbic Acid”로 대체되어 모두 검색된다.

가. 주표목 (Main Headings)

주표목은 생의학문헌에 나타난 개념들을 표현하는 용어 중 주요개념이나 논문의 주제를 표현하는 용어이다. 그림 4는 MeSH Browser에서 “Type 2 Diabetes Mellitus”를 검색한 결과 화면이다. MeSH 표목은 도치된 형태의 “Diabetes Mellitus, Type 2”이고 기입어가 16개 단어, 주석(Scope Note), 허용 한정어(Allowable Qualifiers, AQ), 관련어(See Also) 등으로 구성되어 있다[4].

주표목에는 문헌유형, 체크태그, 한정어이면서 동시에 주표목으로도 쓰이는 MeSH 표목이 있다. 예를 들면 ‘Poisoning’은 “Occurrence of childhood poisoning in Korea”와 같은 문장의 주제를 표현하기 위해 주표목인 “Poisoning”으로 쓰이지만 “Drug treatment of digoxin overdose”와 같은 문장에서는 주표목인 “Digoxin”의 중독이라는 측면을 상세하게 색인하기 위해 “Digoxin /poisoning”과 같이 한정어 “/poisoning”로도 쓰인다.

그림 4. “Diabetes Mellitus, Type 2”의 MeSH Browser 화면

나. 문헌유형 (Publication Types)

문헌유형은 비주제 디스크립터로 원저(original article), 종설(reviews), 증례보고(case reports) 등 문헌의 유형을 표현하기 위해 사용하는 MeSH이다. 2006년에 136개의 문헌유형이 범주 [V] “Publication Characteristics”로 MeSH에 흡수되었다[8]. 2013 MeSH의 문헌유형은 151개이다[9].

다.  체크태그 (Check Tags)

생의학 논문의 <연구재료 및 방법>에는 연구 결과를 얻기 위해 사용한 연구대상, 재료, 그리고 방법이 자세히 기술되어 있는데 임상논문의 경우 환자의 수, 연령, 성별 등을, 실험논문의 경우 동물의 이름과 종류를 기술한다. 이러한 용어를 체크태그라고 한다.

체크태그에는 이러한 인간과 동물을 대상으로 한 종별(species: humans, animals), 남성과 여성을 구별하는 성별(gender), 연령 그룹(age groups), 그리고 특정 동물명 등 연구 대상이나 그 밖의 속성을 표현하는 용어가 있다. 이외에도 시대를 100년 단위로 구분해 놓은 시대관련 MeSH 표목과 국가의 지원금을 받아 수행한 연구논문 관련 MeSH 표목이 체크태그에 속한다.

다음의 표 1은 NLM에서 체크태그의 입력을 위해 사용하고 있는 입력용지로 A-N까지는 연령그룹, J-U는 동물, V는 인간 W-X는 성별을 체크하도록 되어 있다. Y와 b는 문헌유형을 나타내고 c-k는 시대별로 l-n은 국가 지원금을 받은 논문의 표기를 위해 사용하였다[9].

	표 1. US NLM MeSH Check tags
	Age Groupes		Animals		Species /Gender/Pub Types		Times/ Grants
A	□ PREGN	J	□ CATS	U	□ ANIMAL	c	□ ACIENT
B	□ INF NEW(to 1mo)	K	□ CATTLE	V	□ HUMAN	d	□ MEDIEVAL
C	□ INF(1-21mo)	L	□ CHICK EMBRYO	W	□ MALE	f	□ 15th CENT
D	□ CHILD PRE(2-5yr)	M	□ DOG	X	□ FEMALE	g	□ 16th CENT
E	□ CHILD(6-12yr)	O	□ GUINEA PIG	Y	□ IN VITRO(PT)*	h	□ 17th CENT
F	□ ADOLESC(13-18yr)	P	□ HAMSTERS	b	□ COMP STUDY(PT)*	i	□ 18th CENT
G	□ ADULT(19-44yr)	Q	□ MICE			j	□ 19th CENT
H	□ MID AGE(45-64yr)	S	□ RABBITS			k	□ 20th CENT
I	□ AGED(65-79yr)	T	□ RATS			l	□ NIH/PHS SUP
N	□ AGED(80+yr)	U	□ ANIMAL			m	□ OTHER US GOVT SUP
						n	□ NON-US GOVT SUP
*In Vitro, Comparative Study는 Publication Types이지만 Check Tags로 입력함

라. 지명 (Geographicals)

지리표목(Geographicals)은 대륙, 지역, 국가, 주, 도시 및 그 밖의 지리적 구분을 나타내는 용어로 범주 [Z] Geographicals에 속해있다. 2013 MeSH 지리표목은 374이다. 하위 범주 [Z01] Geographic Locations는 12개의 지리표목이 있는데 아프리카, 아메리카, 남극, 북극, 아시아, 호주, 오세아니아, 유럽, 도시, 역사적 지리명, 대양과 바다로 구성되어 있다.

2.2.2 한정어 (Qualifiers)

한정어는 주표목의 여러 가지 측면 즉, 치료, 수술, 역학, 병의 원인, 약물치료 및 효과 등에 대하여 세부적으로 표현하기 위한 용어이다. 부주제적인 측면으로 제한한다는 의미에서 부표목(subheadings)으로 불리우며 공식적으로는 한정어라는 용어를 사용한다. 주표목과 같이 사용할 때는 주로 부표목이라는 명칭을 사용한다.

부표목을 이용하여 색인이나 검색을 하게 되면 해당 주제를 더욱 구체적으로 나타낼 수 있다. MEDLINE에서는 주표목과 조합하여 사용하는데 주표목에 “/”를 한 후 부표목을 표기한다. 또한 주표목에 모든 부표목이 사용되지 않고 허용하고 있는 부표목 즉, 허용 한정어가 정해져 있다. 2014 MeSH에는 현재 83개의 부표목이 있다.

표 2. MeSH Qualifier
no	Qualifier	no	Qualifier
1	analysis	43	isolation & purification
2	abnormalities	44	legislation & jurisprudence
3	administration & dosage	45	manpower
4	adverse effects	46	poisoning
5	agonists	47	pharmacokinetics
6	analogs & derivatives	48	physiology
7	blood	49	metabolism
8	anatomy & histology	50	secretion
9	antagonists & inhibitors	51	organization & administration
10	biosynthesis	52	epidemiology
11	cerebrospinal fluid	53	ethnology
12	blood supply	54	mortality
13	urine	55	diet therapy
14	chemical synthesis	56	drug therapy
15	chemically induced	57	nursing
16	cytology	58	physiopathology
17	pathology	59	radiotherapy
18	complications	60	prevention & control
19	congenital	61	rehabilitation
20	contraindications	62	surgery
21	chemistry	63	transplantation
22	deficiency	64	classification
23	diagnosis	65	education
24	diagnostic use	66	ethics
25	radiography	67	secondary
26	drug effects	68	history
27	radionuclide imaging	69	injuries
28	ultrasonography	70	statistics & numerical data
29	embryology	71	supply & distribution
30	genetics	72	methods
31	enzymology	73	therapeutic use
32	immunology	74	therapy
33	microbiology	75	toxicity
34	virology	76	transmission
35	etiology	77	pathogenicity
36	parasitology	78	trends
37	growth & development	79	psychology
38	economics	80	ultrastructure
39	standards	81	radiation effects
40	pharmacology	82	utilization
41	innervation	83	veterinary
42	instrumentation

2.2.3 보조개념 레코드 (Supplementary Concept Records)

보조개념레코드는 MEDLINE에 수록된 문헌의 화학물질에 대한 시소러스로 2013년 현재 214,234개의 용어로 이루어져 있다. 1년에 한번 갱신되는 MeSH와는 달리 보조개념레코드는 매주 갱신되는데 화학물의 물질명, Chemical Abstracts Service (CAS) 등록번호, 유사어, 화학물을 색인할 때 대응되는 MeSH (Heading mapped to (HM), 이하 MeSH 매핑 표목), 물질의 약리작용(Pharmacological Action(PA), 이하 약리작용 표목), 화학물이 기술된 MEDLINE 서지정보 등을 제공한다. 그림 6은 MeSH Browser에서 물질명 “FG 5865”를 검색한 결과화면이다.

그림 5. “FG 5865”의 MeSH Supplementary Concept Data

그림 6. 의학용어사전 3판에 사용된 기호의 일람

의학용어사전 3판의 MeSH 및 UMLS 용어 표기의 용례를 살펴보면 그림 7과 같다.  Neoplasm의 경우 [M+] 표시와 (C04)를 통해 MeSH 표목임을, 질병범주(C)아래 하위범주인 (C04)용어임을 알 수 있다.  또한 ‘= neoplasia’와 같이 표시함으로 동의어가 Neoplasia임을 알 수 있다. 단, 2014 MeSH에서는 MeSH 표목은 Neoplasms로 복수형이지만 의학용어사전에서는 Neoplasm으로 단수형으로 기술되어 있다.

그그림 7. 의학용어사전 3판의 MeSH 및 UMLS 용어 표기 예

3. 의학용어집 발간을 위한 MeSH 사용

3.1 일본 의학용어사전에서의 MeSH 사용 사례

일본의학회 의학용어관리위원회에서는 『의학용어사전 3판』(이하 의학용어사전)을 2007년에 출판하였다. 의학용어사전은 웹(http://www.med.or.jp/jams/)과 CD-ROM으로도 검색이 될 수 있게 제작하였는데 2판과는 달리 2006 MeSH와 Unified Medical Language System(UMLS) 2006AC의 용어인 경우 각각 [M]과 [U]로 표시하였다[10].

의학용어사전에 사용된 기호의 일람은 다음의 그림 6과 같다. [M+]은 MeSH 표목에 해당하고, [M]은 MeSH의 기입어이다. [U]는 UMLS에서 사용된 용어를 나타낸다. (A01) 등이 괄호안에 표기된 경우는 MeSH의 하위범주를 의미한다. 즉, 용어가 MeSH 표목이거나 MeSH 기입어인 경우 괄호안에 해당 하위범주를 표시하고 있다. ‘=’는 동의어가 있는 경우 표시, “->” 표시는 “∼를 보라”의 의미로 동의어를 基本語(MeSH 표목)로 참조하라는 의미이다.

UMLS는 전세계 100종이 넘는 의학용어집의 메타시소러스이다. 따라서 MeSH도 포함되어 있다. 의학용어사전 편집방침과 범례에 의하면 의학용어사전에서는 MeSH 용어가 UMLS에 포함되어 있으므로 MeSH 용어에 대하여 [U] 표시를 생략하고 있다.

일본어가 없는 Neoplasia는 MeSH 표목이 아닌 MeSH 기입어이면서 UMLS 용어로 의학용어사전에는 Neoplasia[U]로 표시하고 해당하는 일본어가 없어 기본어 즉 MeSH 표목인 “-> neoplasm”으로 상호참조 표시하고 있다.

다음의 그림 8은 Neoplasms의 2014 MeSH 디스크립터 데이터이다. 이를 의학용어사전의 편집방침에 적용시켜보면 Neoplasms는 동의어로 “Neoplasms [M+](C04) = Benign Neoplasms, Cancer, Neoplasia, Neoplasm, Benign Neoplasm, Tumors”이다. 각각의 기입어들은 영어에 해당하는 일본어가 있어 알파벳순으로 배열하고 Tumors[M](C04)와 같이 기술하고 있다.

그림 8. Neoplasms의 2014 MeSH 디스크립터 데이터

그림 7에서 Neonate는 "Neonate[M](M01)-> newborn infant”로 표기하였는데 이는 MeSH 기입어로 M(named groups)의 하위범주 M01(persons)에 해당하는 용어임을 알 수 있다. 또한, 해당하는 일본어가 없어 MeSH 표목인 Newborn infant로 상호참조하고 있다.

Neoplastic cell transformation[M+](C04, C23)용어는 MeSH 표목으로 C04 (neoplasms)와 C23 (Pathological Conditions, Signs and Symptoms) 하위범주 하의 용어이다. Neoplastic transformation이 동의어인데 Neoplastic transformation는 MeSH 기입어는 아니고 UMLS 용어로 해당하는 일본어가 있는 용어로 “->”를 하지 않고 “=”로 표시하고 있다.

3.2 KoreaMed의 서지데이터 활용

KoreaMed는 대한의학학술지편집인협의회 (Korean Association of Medical Journal Editors, KAMJE)에서 구축하고 있는 우리나라 의학학술지 206종에 대한 초록 데이터베이스이다[11]. KoreaMed 전 레코드에는 MeSH가 모두 부여되어 있다. KoreaMed MeSH Indexer는 논문의 제목, 초록, 저자키워드의 용어와 MeSH 표목과 MeSH 기입어가 매칭한 의학용어에 대하여 MeSH 표목을 부여하고 있다. UMLS와 MeSH에서 매칭되지 않은 용어는 신생어이거나 불용어라 할 수 있다. 따라서 KoreaMed에서 MeSH로 매칭이 되지 않은 신생어를 대상으로 매년 혹은 의학용어집 발간시에 추가할 용어의 대상으로 정리를 하여 반영하는 것도 필요할 것이다.

4. 결론

본 글에서는 MeSH의 특징과 유형을 알아보고 의학용어집에 MeSH를 활용한 사례를 살펴보았다.

의학용어집의 작성시에 의학용어가 MeSH 혹은 UMLS 용어인지를 구별할 수 있도록 정보를 제공하는 것은 의학용어사전을 이용하는 독자와 의학용어를 편찬하는 편집자에게 용어에 대한 사전적 정보이외에 부가적 정보를 제공한다는 점에서 유용하다. 또한 MeSH의 16개의 범주와 계층구조를 활용하여 의학용어를 범주화할 수 있고,  MeSH의 기입어와 관련어를 의학용어사전에 사용한다면 독자로 하여금 의학용어의 유사어 및 관련어를 찾아볼 수 있는 접근점을 많이 제공할 수 있어 유익할 것이다.

전술한 바와 같이 MeSH는 전세계적으로 의학관련 데이터베이스, 의료 정보, 단행본 그리고 논문등 학술문헌의 분류 및 색인을 위해 사용하고 있는 생의학분야에서 가장 성공적인 시소러스라 할 수 있다. 특히 MeSH는 매년 새로운 연구의 경향을 반영하여 신조어의 추가, 기존 용어의 삭제 및 변경을 하는 등 MeSH 용어의 관리가 체계적으로 일관성있게 이루어지고 있는 시소러스이다. 또한 매년 변경된 MeSH가 일괄적으로 MEDLINE의 MeSH에 반영된다. 따라서 의학용어집의 발간에 있어 MeSH를 활용한다면 우리 의학용어의 국제적인 통일성과 용어의 일관성을 유지시켜줄 수 있을 것이다.

숙명여자대학교 이춘실 교수님의 노력으로 "Seoul"이라는 지명이 2015 MeSH 표목으로 채택될 예정이다. 이렇듯 의학용어집 편찬의 성과가 국제적인 통제어휘집인 MeSH 혹은 UMLS에 반영될 수 있도록 NLM과 협력하는 것도 중요할 것으로 생각된다.

< 참고문헌>

[1]	National Library of Medicine(U.S). 2013. Preface [cited 2014.5.12]. from http://www.nlm.nih.gov/mesh/intro_pre face.htm l#pref_rem.

[2]	National Library of Medicine(U.S). MEDLINE indexing: Online training course. [cited 2014.5.12]. from http://www.nlm.nih.gov/ bsd/indexing/training/USE_010.html

[3] International Committee of Medical Journal Editors. 2013. Uniform requirements for manuscripts submitted to biomedical journals: writing and editing for biomedical publication. 2006th ed. [2014.5.12.].

from http://www.kamje.or.kr/intro.php?body=uniformreq_2006

[4]	MeSH Browser. http://www.nlm.nih.gov/mesh/MBrowser.html

[5]	Files abailable to download. http://www.nlm.nih.gov/mesh/filelist.html

[6]	Introduction to MeSH 2014. (http://www.nlm.nih.gov/ mesh/introduction.html#changes).

[7]	정소나. 2013. KoreaMedd의 MeSH 반자동 색인 시스템 개발 및 평가 연구. 서울 : 숙명여자대학교 박사학위논문.

[8]	Schulman, J., 2005. “What's New for 2006 MeSH®”. NLM Tech Bull. Nov-Dec(347):e8.

National Library of Medicine(U.S). 2013g. MeSH Record Types. [cited 2014.5.12]. from http://www.nlm.nih.gov/ mesh/intro_record_types.html.

[9]	NLM Indexing Initiative. 2013. Medical Text Indexer Processing Flow. [cited 2014.5.12]. from http://skr.nlm.nih.gov/

(http://www.nlm.nih.gov/mesh/introduction.html#changes)

[10]	日本醫學會醫學用語管理委員會 編, 2007. 『日本醫學會醫學用語辭典 :英和』東京 :南山堂, 2007.

[11]	KoreaMed. http://koreamed.org/

주제발표2:  UMLS 소개

김석일

(가톨릭의대 의료정보학 교수 / 대한민국의학한림원 의학용어개발 및 표준화위원)

UMLS

UMLS (Unified Medical Language System)는 1986년부터 미국국립의학도서관(NLM, National Library of Medicine)에서 장기 연구개발 과제로 개발하였다. 당시 컴퓨터로 읽어들일 수 있는 형태의 정보는 많았지만, 같은 개념이 컴퓨터 시스템 마다 혹은 사용하는 사람 마다 매우 다양하게 표현되고 있고, 유용한 정보라 하더라도 전혀 다른 여러 데이터베이스와 정보시스템에 분산되어 있었다. UMLS는 이 두 가지 중요한 문제를 극복하고 효과적인 정보 검색을 할 수 있도록 하는 것이 목적이었다. 의사, 전산전문가 및 정보관련 학자, 언어학자 등이 연구 팀을 이루고, 미국국립의학도서관의 연구비를 지원받는 외부 연구 기관들과 협력체계를 구성하여 개발하였다. 그 산출물을 Knowledge source 라 부르며, CD-ROM 혹은 web site에 RRF 형식으로 제공한다. 활용은 의학문헌 검색, 진료 지침 작성, 환자의무기록, 공중보건학적 자료의 부호화를 염두에 두고 있다. 주 사용 대상자는 일반인이 아니라 개발자로 규정하고 있다.

예를활용한UMLS 설명

영어 의학용어로서 Addison’s disease는 동의어로서 여러 용어를 사용할 뿐 아니라 이를 포함하고 있는 체계의 계층구조에 따라 비슷하지만 조금씩 다른 의미를 갖는다 (그림1).

그림1, 의학용어로서 Addison's disease의 영어 표현

개념중심의동의어처리

이와 같은 다양한 자료원 (vocabulary source) 에서 나타나는 표현을 정리하기 위해서는 먼저 같은 의미를 갖는 용어들을 개념에 따라 하나의 집합을 구성하고, 그 개념을 대표하는 용어 (Preferred term)을 집합에서 하나 꺼내어 부여한다. 이 때, 컴퓨터가 인식할 수 있도록 각 개념에는 고유번호 (Concept Unique Identifier, CUI) 를 부여한다 (그림2).

그림2. 서로 다른 자료원의 Addison's disease 동의어 처리 및 개념 고유번호 부여

계층구조정리

Addison’s disease는 각 자료원에서 각각 서로 다른 계층구조 내에 위치한다. 그림3에서는각각MeSH와 ICD-10에서 Addison’s disease가 차지하고 있는 계층내 위치가 서로 다름을 알 수 있다.

그림3. MeSH와 ICD-10에서 Addison's disease의 계층내 위치

서로 다른 용어체계 또는 분류체계에 나타나는 같은 개념이라도 컴퓨터가 인식하기 위해서는 서로 다른 계층구조를 모두 반영하는 새로운 구조가 필요하게 된다. 그림4는서로다른 3개의 용어체계를 하나로 합하는 가상의 예이다 이와 같은 작업을 4개의 자료원에 나타나는 Addison’s disease에 적용하면 그림5에서와같은통합계층구조를얻을수있다.

이 과정에서 자료원의 계층구조는 모두 통합하고, 여러 경로를 통해 계층구조의 중복을 허용하게 되는데, 이를 다중 상속(Multiple inheritance)이라고 부른다.

그림4. 서로 다른 계층구조의 논리적 통합

그림5. 여러 자료원에 나타나는 Addison's disease의 계층구조 통합

UMLS의 구성

UMLS는 Metathesaurus, 의미망 (Semantic network) 및 전문어휘목록(specialist lexicon) 으로 이루어져 있다.

Metathesaurus

Metathesaurus는 UMLS의 가장 중요한 구성 요소로서 의학에서 사용중인 여러 가지 자료원에서 볼 수 있는 용어와 그 개념을 포함하고 있다. 본래 자료원에 해당하는 어휘들의 합집합이 전체 포함 범위이다. 자료원에서 용어의 의미, 용어간 계층 관계를 비롯한 다른 연관 관계를 유지한 상태에서 각 개념에 대해 별도의 기본 정보를 추가하고, 개념과 용어간의 관계를 새로 정리하였다. 모든 용어는 개념 즉, 의미에 따라 정리하였다.

개념의 속성에는 고유번호와 사전적 정의가 포함된다. 개념과 개념을 연결하는 관계도 표현이 되어 있는데, 관계에 포함되는 속성은 관계의 종류와 자료원이다. 현재 자료원은 의학계에서 사용하고 있는 용어체계, 분류체계, 코드집 등이며 2014년 현재 150개가 포함되어 있다. 이 중 MeSH, ICPC, ICD-10 등은 영어 이외의 다른 나라 언어도 포함되어 있다.

Metathesaurus를 이루는 고유번호는 4가지가 있다. 개념 (CUI), lexical variants (Lexical Unit Identifier, LUI), 같은 문자열 구성으로 이루어진 용어 (String Unit Identifier, SUI) 및 자료원 별로 서로 다른 고유번호로서 (Atom Unit Identifier, AUI)가 있다. 이 고유번호들은 UMLS를 관리 및 활용하는데 가장 기본적인 자료로서 활용된다.

개념은 시간이 흐르더라도 원칙적으로 사라지지 않는다. 즉, CUI는 한 번 부여되면, 바뀌지 않는다. 그러나, 하나의 개념이 다른 개념과 통합되거나 분리되면서 새로운 개념이 나타나서 논리적으로 삭제된다.

Semantic Network (의미망)

의미망은 135개의 의미형(semantic type)과 54개의 관계 (semantic network relationship) 를 포함하고 있다. 의미형은 metathesaurus의 모든 개념을 계층구조 내의 위치와 별개로 상위 수준에서 분류해 주고 있다. 두 개 의미형의 관계는 하위수준인 개념간의 관계를 추정하는데 사용할 수 있다 (그림6).

그림6. 의미망에서 표현된 의미형(semantic type, 네모) 및 관계(relationship, 화살표와 이탤릭체 이름)

전문어휘목록(specialist lexicon)

UMLS의 세 번째 구성요소는 전문어휘목록(specialist lexicon) 이다. 이 것은 의학용어와 일반용어를 모두 포함하고 있다. 각 용어에 대한 문법, 형태(어형변화, 파생어, 복합용어 구성 방법), 철자정보 등이 포함되어 있으며, 자연어 처리 등에 활용한다.

우리나라의 UMLS

우리나라의 UMLS도입

우리나라에서 보건복지부 표준화 위원회를 운영하면서 UMLS metathesaurus 구조를 표준 용어체계의 틀로 받아들였다.

우리나라 의학용어의 특성상 많은 동의어가 있고, 대표용어에 대한 논란도 있다. 이 것을 감안하여, 동의어에 각각 고유번호를 부여하고, 용어가 의미하는 개념을 대표하는 대표용어를 선정한 후, 대표용어의 고유번호를 개념의 고유번호로 할당하였다. 이 때, 대표용어는 UMLS의 원칙과 같이 그 개념을 지칭하는 표준말이 아니라, 개념을 이해하기 위한 표지로 이해하여야 한다.

우리나라의학용어의UMLS등재

2007년부터 김석일 등은 UMLS에 우리나라 용어를 등재하기 위해 NLM의 Stuart Nelson박사와 상의하였는데, 그는 UMLS 등재를 위해서는 기존 분류체계 또는 용어체계가 있는 것을 택하는 것이 좋다고 ICD-10의 한글판을 추천하였다. 그의 권고에 따라 ICD-10을 번역하여 고시하고 있는 통계청과의 협의와 자료 정리 후 NLM에 제출하여 수 차례 자료구조에 대한 논의를 거쳐 2009AA(09년 Apr.)판에 등재하였다. 등재 대상은 KCD-5용어 17,937개중 조합코드(6,930개)를 제외한 11,007개였다.

우리나라의학용어연구와관련된시사점

우리나라의 의학용어는 발달 과정에서 한 가지 개념에 많은 동의어가 나타나게 되었다. UMLS는 개념 중심의 용어정리를 통해 서로 다르게 표현된 용어들을 잘 관리하면서도 의미의 영속성을 유지할 수 있도록 하는 방법론을 알려주고 있다.

또, UMLS는 미국에서 개발하였지만 전 세계에 무료로 이용할 수 있도록 허락하고 있다. 따라서, UMLS의 CUI와 우리 의학용어의 고유번호를 잘 연결시키면, 현대의학에서 나타나는 개념을 명확하게 정리할 수 있으며, UMLS에 포함되어 있는 다른 정보를 활용하는 것이 가능하다.

지정토론1 : MeSH 용어 부여 및 사용의 새로운 방향: KoreaMed MeSH

이춘실

(숙명여대 문헌정보학과 교수)

MeSH (Medical Subject Headings)는 잘 알려진 바와 같이 미국 국립의학도서관 (US National Library of Medicine)에서 의학문헌의 효율적인 검색을 목표로 개발하여 계속 유지 관리하고 있는 의학 주제용어사전 (thesaurus)이다. NLM의 의학문헌 데이터베이스인 MEDLINE (일반적으로는 PubMed라고 호칭)은 수록 논문의 주제를 MeSH 용어를 사용하여 전문가 (MeSH Indexer)들이 색인하여, 이용자들이 MeSH 용어로 의학문헌의 주제 검색을 체계적으로 할 수 있는 기반을 갖추고 있다.

대한의학학술지편집인 협의회에서 구축하고 있는 우리나라 의학문헌의 영문 초록 데이터베이스인 KoreaMed (http://koreamed.org)에서는 MeSH로 주제 색인을 하기 위한 여러 가지 노력을 하여 왔으나, 미미한 인적 물적 자원의 한계로 여의치 못한 아쉬움을 갖고 있었다. 4년 전인 2010년에 MeSH check tags 자동 부여 작업을 시작으로 독자적인 “KoreaMed MeSH 자동 색인 시스템”을 개발하여, 최근 (2014년 4월 7일)에 KoreaMed의 21만개 모든 레코드에 MeSH 주제어를 부여하는 작업이 완료되었다. 특히 신규로 KoreaMed에 입력되는 레코드에는 MeSH 용어가 즉시 부여되고 있다. 디스크립터 (Descriptors), 한정어 (Qualifiers) 뿐만 아니라 물질명 (substances) 등 보조개념 레코드 (Supplementary Concept Records, SCRs) 용어도 모두 부여하고 있다.

KoreaMed에서는 다음과 같은 원칙을 세우고, 단순화된 KoreaMed MeSH 자동 색인 시스템을 구축하였다.

1. 가능한 많은 주제어를 부여한다.

2. Subheading을 main heading으로 부여한다.

(pre-coordinate 시스템이 아니다.)

3. 계층 (hierarchy)을 따라 explode 하지 않는다.

대신에 상위어, 하위어를 모두 부여한다.

4. 가능한 많은 entry terms를 추가한다.

특히 국내 의사들이 사용하는 한국식 영어 어휘를 추가한다 (KoreaMed entry terms).

(UMLS의 관련어휘도 고려 대상이나, 현재 구현하지 않음)

MEDLINE은 전문가가 직접 주제분석을 하여 MeSH 색인을 하는 human indexing 시스템인데 비하여, KoreaMed의 MeSH 자동 색인 시스템은 초록에 있는 단어 (text words)를 MeSH 용어와 기계적으로 비교하여 matching하는 machine indexing 시스템이기 때문에, 주제 분석의 정교한 점에서 부족한 점이 있으나, 신속하게 부여할 수 있다는 점이 장점이다. KoreaMed에 기 수록된 20여만 편의 논문과 연간 11,000편 정도 추가되는 의학논문의 주제색인 작업을 할 수 있는 잘 훈련된 충분한 숫자의 MeSH indexer가 없는 국내 현실에서, 이러한 자동 색인 시스템을 고려하는 것은 필연적일 수밖에 없었다.

그러나 KoreaMed에서 단순화된 MeSH 자동 색인 시스템을 자신있게 구현한 동기는, 실제 의학연구자, 의사 등 이용자들이 점점 더 단순 키워드 검색을 하고 있으며, main heading/subheading과 같은 전조합 (pre-coordinate)의 복잡한 구조를 가진 MeSH 검색을 불편해 하며, 그것보다는 차라리 다양한 키워드를 임의로 후조합 (post-coordinate)하여 검색하는 것을 선호한다는 것이다. MeSH 용어가 개발되던 초기에는 Index Medicus라는 색인지에 논문을 분류하여 경제성 있게 수록하는 방법으로 main heading과 subheading을 pre-coordinate하여 배열하는 것이 좋은 방법이었겠지만, 데이터베이스 관련 기술이 매우 발전한 현재에는 그러한 용도는 거의 소멸하였고, 한 논문의 여러 측면을 복합적으로 아우르는 주제 표기 방법으로 사용된다고 볼 수 있다. PLoS 같은 학술지에서는 주제어로 MeSH 급의 용어를 사용하나, “Endoscopy, Digestive System”와 같은 도치된 형태의 용어 (inverted terms) 등을 사용하지 않으며, 여러 개의 단어로 구성된 용어보다는 짧은 용어를 사용한다.

2014년 3월 31일과 4월 3일 두 차례에 걸쳐 KoreaMed MeSH 팀이 NLM의 MeSH section 그리고 MTI section과 가졌던 회의에서, NLM에서도 급증하고 있는 MEDLINE 논문을 human indexer가 일일이 색인하는 것의 한계를 절실하게 느끼고 있다고 하였으며, 실제로 MTI (NLM Medical Text Indexer)로 추천받은 용어를 참조하여 MeSH 색인 작업 시간을 줄이는 논문 그룹과 MTI로 추천한 용어를 그대로 시스템에 반영하는 논문 그룹을 정하는 등, 새로운 MeSH indexing workflow를 적용하고 있다고 하였다. 특히 MTI가 너무 많은 MeSH 용어를 추천하는 (그래서 불필요한 용어를 다수 포함하는) 문제점을 보완하기 위하여 MTI의 기능을 단순화한 “MeSH on Demand” (http://ii.nlm.nih.gov/Interactive/MeSHonDemand.shtml)를 최근 개발하고, 논문의 저자들이 초록의 단어들을 활용하여 자신의 논문에 적절한 MeSH 용어를 쉽게 찾아낼 수 있는 시스템으로 홍보하고 있다. Journal of Korean Medical Science 2014년 1월호에 실린 논문 26편에 대하여 “KoreaMed MeSH 자동 색인 시스템”이 부여한 MeSH 용어와 “MeSH on Demand”가 부여한 MeSH 용어를 비교하였는데, 매우 유사한 결과 (대부분의 논문, 85% 이상 일치)를 보였다. 각 논문에 부여된 MeSH 용어를 일일이 같이 비교하여 보던 MTI와 MeSH on Demand 개발자들이, KoreaMed MeSH 자동 색인 시스템이 매우 시의적절한 원칙을 가지고 잘 개발된 훌륭한 시스템이라고 극찬하였을 뿐만 아니라, 현재 NLM의 MeSH indexing team이 갖고 있는 딜레마에 견주어 볼 때 매우 부럽다고 하였다.

MeSH는 매우 체계적인 의학용어 thesaurus이다. 그런데 이러한 체계적인 시스템이 갖고 있는 main heading/subheading, broader term/narrow term hierarchy 등의 장점이, 새로운 성향을 가진 이용자들에게는, 다양한 시스템에 접목되어 사용되어지려면, 그리고 정보의 대량처리에는 매우 제한점을 가진 것으로 표출되고 있다. 이러한 제한점을 극복하려는 다양한 시도가 계속될 것이며, MeSH는 대표적인 의학용어로서 계속 자리매김을 할 것이다.

지정토론2 :

부유경

(을지대학교 의료경영학과 교수)